%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%% Modelo de tese com capítulos individuais
%%
%% Neste formato, cada capítulo é preparado de maneira que possa ser lido individualmente, muitas vezes baseado
%% em trabalho publicado em revista científica na forma de artigo. Assim sendo, cada capítulo possui
%% aproximadamente a mesma estrutura de um artigo, quais sejam: resumo, abstract, introdução, material e
%% métodos, resultados, discussão, e conclusões.
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%%=============================================================================================================
%% Definições gerais - tipo de documento
%%=============================================================================================================
%% Tipo de documento e a classe a ser usada para sua formatação.
%\documentclass[tese, header, twoside, openright]{UFRuralRJ} %%% original
\documentclass[tese, header, oneside, openright]{UFRuralRJ}
%% A opção 'openright' força inícios de capítulos em páginas ímpares
%\documentclass[openright]{UFRuralRJ}
%% Use a opção 'twoside' para gerar uma versão frente-e-verso
%\documentclass[twoside]{UFRuralRJ}
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - língua, codificação e fonte
%%=============================================================================================================
%\usepackage[brazilian, english, spanish]{babel} %% use 'english' para documento escrito em inglês % não foi necessário usar spanish
\usepackage[brazilian, english]{babel} %% use 'english' para documento escrito em inglês
%\usepackage[english]{babel}
%%% Para a fonte padrão Latex, usar:
%\usepackage[T1]{fontenc} %% Conjunto de caracteres correto (para usar com compilador pdfLaTeX ou XeLaTeX YG; cometado por YG)
%%%\usepackage[utf8]{inputenc} %% Para acentuação correta (cometado por YG)
%%% ou
%%% Para a fonte Times New Roman, usar: (Adicionado por YG)
\usepackage{fontspec} %% Para Font Times New Roman é necessaŕio o compilador XeLaTeX (de fato somente funciona com compilador XeLaTeX YG)
\setmainfont{Times New Roman} %% Para Font Times New Roman (YG) https://pt.overleaf.com/learn/latex/XeLaTeX
%%\setmainfont{DejaVu Serif} %% Para Font DejaVu Serif (YG)
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - formatação de equações e números
%%=============================================================================================================
\usepackage{amsmath,latexsym,amssymb}
\usepackage{siunitx} %% Sistema Internacional de Unidades
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - formatação de figuras
%%=============================================================================================================
%% Importar figuras corretamente
\usepackage{graphicx}
%% Diretório onde estão as figuras dos capítulos
%\graphicspath{{capitulos-b/figuras/}}
\graphicspath{{tese_capitulos/}} %%% yuri ppgctia
\usepackage{float}
\usepackage{wrapfig}
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - formatação de hyperlinks e urls
%%=============================================================================================================
%% Opção 'hidelinks' disponível no pacote 'hyperref' a partir da versão 2011-02-05 6.82a. 'hidelinks' retira
%% os retângulos do entorno das palavras com links.
\usepackage[%hidelinks%,
bookmarksopen=true, linktoc=page, colorlinks=true,
linkcolor=blue, citecolor=blue, filecolor=magenta, urlcolor=blue,
pdftitle={UFRuralRJ -- Classe LaTeX para formatação de documentos acadêmicos na UFRRJ},
% pdfauthor={Graziela Barroso}, %%% original
pdfauthor={Yuri Gelsleichter},
pdfsubject={Tese de Doutorado},
pdfkeywords={LaTeX, UFRuralRJ, Documentos acadêmicos}
]{hyperref}
%% Pacote para lidar com url longa, deve ser carregado depois do pacote 'hyperref'
%\usepackage[hyphenbreaks]{breakurl} %%% deu conflito no overleaf com o compilador pdflatex, por isso comentar
%% Se o pacote 'hyperref' acima foi carregado, a linha abaixo corrige um bug na
%% hora de montar o sumário da lista de figuras e tabelas. Comente a linha se o
%% pacote 'hyperref' não foi carregado.
%\input{macros/bugcaption}
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - formatação da bibliografia de acordo com as normas da ABNT
%%=============================================================================================================
% O pacote 'abntex2cite' precisa, obrigatoriamente, ser carregado depois do pacote 'hyperref'.
% Mais informações podem ser obtidas na página do pacote no GitHub: https://github.com/abntex/abntex2
\usepackage[alf, abnt-and-type=&, abnt-etal-cite=2, abnt-etal-list = 0]{abntex2cite}
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - formatação de verbatim
%%=============================================================================================================
%% O ambiente verbatim é o ambiente onde são inseridos exemplos de código fonte.
%% Está opção adiciona cor de fundo ao ambiente verbatim.
%% Comente para desabilitar.
\let\oldv\verbatim
\let\oldendv\endverbatim
\def\verbatim{\par\setbox0\vbox\bgroup\oldv}
\def\endverbatim{\oldendv\egroup\fboxsep0pt
\noindent\colorbox[gray]{0.8}{\usebox0}\par}
%%=============================================================================================================
%% Pacotes - outros
%%=============================================================================================================
% \usepackage{showframe}
\usepackage{blindtext} %% Amostra de texto (\blindtext[1])
%\usepackage{times} %% Usar fonte Adobe Times Roman, equivalente à Times New Roman
\usepackage{threeparttable} %%% foot note on tables
\usepackage{longtable} %%% to several pages tables (long tables)
\usepackage{subcaption} %%% figuras com mais de uma descrição
\usepackage{threeparttablex} % for "ThreePartTable" environment
\usepackage{booktabs} % for well-spaced horizontal rules
\captionsetup{skip=1pt} %%% distancia entre legenda e figura e tabela %%% opcional font=small, justification=raggedright,singlelinecheck=false
%%%%%% \usepackage{fancyhdr} %%% controlar numero da primeira página do apêndice
\usepackage{listings} %%% for display R code %%% acabei não utilizando
\lstset{language=R, %%% configuratiobn of package "listings"
basicstyle=\small\ttfamily,
stringstyle=\color{green},
otherkeywords={0,1,2,3,4,5,6,7,8,9},
morekeywords={TRUE,FALSE},
deletekeywords={data,frame,length,as,character},
keywordstyle=\color{blue},
commentstyle=\color{green},
}
%%=============================================================================================================
%% Identificação do trabalho
%%=============================================================================================================
\titulo{Titulo do trabalho} %% Título
\author{Sobrenome}{Nome} %% Autor: sobrenome, nome
%\autoratrue %% Usar no caso de uma AUTORA
%\instituto{PRÓ-REITORIA DE PESQUISA E PÓS-GRADUAÇÃO} %% Instituto
\instituto{Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação} %% Instituto
%\curso{PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM CIÊNCIA, TECNOLOGIA E INOVAÇÃO EM AGROPECUÁRIA} %% Curso de pós-graduação
\curso{Programa de Pós-graduação em Ciência, Tecnologia e Inovação em Agropecuária} %% Curso de pós-graduação
\area{Recursos Naturais e Proteção Ambiental} %% Área de concentração
\local{Seropédica}{RJ}{Brasil} %% Local da defesa
%%=============================================================================================================
%% Identificação dos orientadores
%%=============================================================================================================
\advisor[Professora]{Dra.}{Sobrenome}{Nome}{UFRRJ} %% Orientadora
\coadvisor[Professora]{Dr.}{Sobrenome}{Nome} %% Co-orientador
%\coadvisor[Pesquisador]{Dr.}{Xavier}{Chico} %% Co-orientador
%%=============================================================================================================
%% Informações sobre a defesa
%%=============================================================================================================
\committee[Ph.D.]{Sobrenome}{Nome}{Instituição} %% Presidente
\committee[Ph.D.]{Sobrenome}{Nome}{Instituição} %% Examinadora
\committee[Dra.]{Sobrenome}{Nome}{Instituição} %% Examinador
\committee[Dr.]{Sobrenome}{Nome}{Instituição} %% Examinadora
\committee[Dr.]{Sobrenome}{Nome}{Instituição} %% Examinador
\date{26}{03}{2020} %% Data da defesa
%%=============================================================================================================
%% identificar problemas com caracters unicode
%%=============================================================================================================
%\DeclareUnicodeCharacter{0301}{*************************************} %%% identificar problemas com caracters unicode %https://tex.stackexchange.com/questions/443018/package-inputenc-error-unicode-char-%CC%81-u301inputenc
%%=============================================================================================================
%% Início do documento
%%=============================================================================================================
\begin{document}
%%% \pagenumbering{roman} %%% YG %%% comentado por YG posteriormente, como esta numeração é opcional optamos por deixar sem
%%=============================================================================================================
%% Capa e folha de rosto
%%=============================================================================================================
\maketitle %%% original
%%% \thispagestyle{empty} %%% para não numerar a folha de rosto YG %%% comentado por YG posteriormente, como esta numeração é opcional optamos por deixar sem
%%=============================================================================
%% Ficha catalográfica
%%=============================================================================
\makeCIP{seuEmail@ufrrj.br} % email do autor
%%=============================================================================================================
% Folha de aprovação
%%=============================================================================================================
\makeapprove
%%=============================================================================================================
%% Dedicatória (opcional)
%%
%% NOTA: Usar versão estrelada de 'chapter'
%%=============================================================================================================
\chapter*{}
\vfill
\begin{flushright}
{\em
Dedico a minha família.
%Àqueles que financiaram meu trabalho...
%\par
%...DEDICO!
}
\end{flushright}
%%=============================================================================================================
%% Agradecimentos (opcional)
%%
%% NOTA: Usar versão estrelada de 'chapter'
%%=============================================================================================================
%\chapter*{Agradecimentos}
%%% o texto de agradecimento pode ser colocado diretamente aqui. Pode ser colocado com o comando: \noindent{text, text} se quiser remover o espaço de identação de cada parágrafo.
%\noindent{Agradeço a Deus pelo dom da vida.... Mais uma vez, deixo aqui o meu muito obrigado!}
%\noindent{À Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro.}
%\noindent{Às agências de fomento.}
%\noindent{Aos orientadores.}
%\noindent{À todos que, direta ou indiretamente, contribuíram para a construção deste trabalho.}
%%% Como esse texto é extenso, preferi adicionar de arquivo .tex externo pelo comando abaixo:
\include{elementos_pre_pos_text/Agradecimentos}
%%=============================================================================================================
%% Biografia (opcional)
%%
%% NOTA: Usar versão estrelada de 'chapter'
%%=============================================================================================================
% \chapter*{Biografia}
% \noindent{O autor nasceu, cresceu e escreveu uma tese.}
%%=============================================================================================================
%% Epígrafe (opcional)
%%
%% NOTA: Usar versão estrelada de 'chapter'
%%=============================================================================================================
% \chapter*{}
% \vfill
% \begin{flushright}
% {\em
% ``Fazer é a melhor forma de dizer.''
% \par
% Autor desconhecido
% }
% \end{flushright}
%%=============================================================================================================
%% Prefácio (opcional)
%%
%% NOTA: Usar versão estrelada de 'chapter'
%%=============================================================================================================
%\chapter*{Prefácio}
%\blindtext[2]
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%% Extended Abstract, Resumen Ampliado, Resumo geral, General abstract
%%=============================================================================================================
%%==============================================================================
%% Resumo geral (português)
%%==============================================================================
\include{elementos_pre_pos_text/Resumo_Geral} %% Incluir Resumo_Geral
%%==============================================================================
%% General abstract (inglês)
%%==============================================================================
\include{elementos_pre_pos_text/General_Abstract} %% Incluir General_Abstract
%% Resumen Ampliado (espanhol)
%%==============================================================================
\include{elementos_pre_pos_text/Resumen_ampliado} %% Incluir Resumen_ampliado
%%==============================================================================
%%==============================================================================
%% Extended Abstract (inglês)
%%==============================================================================
\include{elementos_pre_pos_text/Extended_Abstract} %% Incluir Extended_Abstract
%%=============================================================================================================
%% Listas (comentar se não houver) e sumário
%%=============================================================================================================
\listoffigures %% Lista de figuras
\listoftables %% Lista de tabelas
%\listofappendix %% Lista de apêndices
%\listofannex %% Lista de anexos
%%=============================================================================================================
%% Lista de abreviações e siglas
%%=============================================================================================================
% pode ser colocada diretamente aqui entre:
%%% \begin{listofabbrv}{UbiComp} %% Lista de abreviaturas e siglas
%\item [UFRRJ] Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
%\item [UFRuralRJ] Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
%%% \end{listofabbrv}
% mas como a minha é muito extensa preferi modificar e adicionar por arquivo .tex externo:
\include{elementos_pre_pos_text/lista_abrev_siglas} %% Incluir lista_abrev_siglas
%%% Lista de siglas (no meu caso (Yuri) usei junto com a lista de abreviações)
%\begin{listofsymbols}{teste} %% Lista de simbolos
% \item [$\varnothing$] vazio %% Simbolos devem aparecer conforme a ordem em que aparecem no texto
% \item [$\Gamma$] Gama %% O parâmetro deve ser o símbolo mais longo
% \item [$\forall$] Para todo
%\end{listofsymbols}
\tableofcontents %% Sumário
%\thispagestyle{empty} %%% a segunda página do sumario estava em algarismo arábico mas deveria ser romano como a primeira, então foi adicionado este comando para não numerar a segunda página do sumário YG
%%% depois dessa solução pesquiseii sobre quebra de seção e encontrei "\breake" : https://www.overleaf.com/learn/latex/line_breaks_and_blank_spaces , funcionou muito bem
%%% \break %%% comentado por YG posteriormente, como esta numeração é opcional optamos por deixar sem
%%=============================================================================================================
%% Início da tese
%%=============================================================================================================
%%% \pagenumbering{arabic} %%% YG %%% comentado por YG posteriormente, como esta numeração é opcional optamos por deixar sem
\include{tese_capitulos/00_intro_geral} %% Incluir Introdução Geral
\include{tese_capitulos/01_chapter_I} %% Incluir capítulo 01
\include{tese_capitulos/02_chapter_II} %% Incluir capítulo 02
\include{tese_capitulos/03_concl_geral} %% Incluir Conclusão Geral
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%% Referências
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%% O arquivo 'references' com as referências bibliográficas deve estar no formato BibTeX.
%%%\shorttitle{Referências bibliográficas}
\renewcommand{\bibname}{REFERENCES} %%% YG, muda de REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS para REFERENCES
\shorttitle{References}
\bibliography{referencias/references} % sincronizado com Mendeley pelo OverLeaf
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%% Apêndices
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%% IMPORTANTE:
%% O Manual da UFRRJ não prevê a inclusão de apêndices, mas apenas anexos. O
%% problema disso é que apêndices e anexos são completamente diferentes.
%% O anexo pode constituir de qualquer material, não necessariamente de sua
%% autoria ou fundamental para o entendimento do seu documento como um todo,
%% ao contrário do apêndice.
%% NOTA:
%% Caso seja necessário inserir seção ou subseção dentro do apêndice, use o
%% comando \tocless para não adicioná-los no Sumário.
%% Exemplo: \tocless\section{Histórico}
\renewcommand{\appendixname}{APPENDIX} %%% YG, muda de Apêndice para Appendix
\appendix %% Comando para criar o apêndice
\include{elementos_pre_pos_text/apendice_a_tables} %% Incluir apêndice A
%\annex %% Anexos
%\include{main/anexoa} %% Incluir anexo A
\end{document}